前列腺癌具有高度異質(zhì)性，個性化治療的快速發(fā)展對基因組圖譜的需求愈加強烈。本文總結(jié)了局限性和晚期前列腺癌的分子突變，尤其強調(diào)了局限性前列腺癌的基因表達(dá)分析和晚期疾病的MSI分析。記得點擊收藏！

轉(zhuǎn)移性去勢抵抗性前列腺癌基因圖譜：CPCT-02隊列的全基因組測序（WGS），包括197個轉(zhuǎn)移性去勢耐藥PCas（mCRPC），結(jié)果顯示，68%的病例可歸為TCGA分類法提出的7個亞型，而且可治療亞型HRD、MSI-H和CDK12-/-（串聯(lián)重復(fù)基因型）與TCGA分子亞組無關(guān)。

對于局限性前列腺癌，建議對極低風(fēng)險患者和大多數(shù)低風(fēng)險前列腺癌患者進(jìn)行主動監(jiān)測。

五種基因表達(dá)檢測方法：Decipher、Decipher PORTOS、Oncotype Dx Genomic Prostate Score (GPS)、Prolaris、ProMark。

NCCN指南建議使用Decipher 或者 Prolaris支持對中高危局部前列腺癌和至少10年的患者進(jìn)行風(fēng)險評估，對于低至有利的中度風(fēng)險患者，允許使用3種檢測(Decipher、 Prolaris、Oncotype DX Prostate)中的任何一種。

對于卵巢癌，Myriad Genetics MyChoice CDx是美國食品和藥物管理局（FDA）批準(zhǔn)的唯一一種用于評估HRD的檢測方法。該方法計算了基因組不穩(wěn)定性評分（GIS），考慮到全基因組雜合性缺失（LOH）、端粒等位基因失衡和大規(guī)模狀態(tài)轉(zhuǎn)換，評分≥42被歸類為高HRD評分。此外，該方法檢測BRCA1和BRCA2的變異和大的重排。

除此之外，其他檢測HRD的方法學(xué)包括：Illumina TruSight Oncology 500 HRD結(jié)合靶向NGS（TruSight Oncology 500）和Myriad HRD檢測，分析了 523個基因的單核苷酸變異、缺失、插入和拷貝數(shù)變異，以及55個基因的融合，也提供了MSI狀態(tài)和TMB的信息。FoundationOneCDx分析提供了關(guān)于基因組LOH（gLOH）評分的信息，gLOH為16或更高被認(rèn)為是“LOH高”。同源重組缺陷的分類器(CHORD) 是一種基于全基因組隨機(jī)森林的方法，用于檢測腫瘤染色體不穩(wěn)定性。另一種有監(jiān)督的學(xué)習(xí)算法-HRDetect, 是一種套索邏輯回歸模型，用于識別乳腺癌腫瘤中的BRCA1和BRCA2突變特征。

據(jù)報道，4%-5%的mCRPC存在MMR基因突變。MSI狀態(tài)可以通過經(jīng)典地IHC評估：MLH1、MSH2、MSH6和PMS2蛋白，另一種策略是通過使用聚合酶鏈反應(yīng)（PCR）對特定的微衛(wèi)星（或串聯(lián)重復(fù)序列）位點進(jìn)行測序來評估MSI狀態(tài)。在過去的幾年里，NGS方法已經(jīng)使多個微衛(wèi)星位點的并行評估成為可能。各類評估方法見表1。

NCCN指南建議對有任何年齡確診、從高危局部階段開始的患者以及有家族前列腺癌病史的患者進(jìn)行胚系檢測。建議胚系Panel包括Lynch綜合征相關(guān)基因MLH1、MSH2、MSH6和PMS2，以及HRD基因BRCA1、BRCA2、ATM、PALB2和CHEK2。其他基因，如HOXB13，也應(yīng)該被考慮。

腫瘤分子分析在局限性PCa和mPCa的個性化臨床管理和精確腫瘤治療中的作用日益彰顯?；蚪M風(fēng)險分層可以為局限性前列腺癌的主動監(jiān)測或強化治療提供有力證據(jù)。對于mPCa，通過NGS評估HRD和MSI狀態(tài)，對于預(yù)測靶向治療的益處至關(guān)重要，如PARP抑制劑和免疫治療。